LAMMPS用マシン | 研究開発者向け情報発信メディア TEGAKARI

建築材料の研究に携わるお客様より、Red Hat Enterprise LinuxでLAMMPSを利用できるPCをご相談いただきました。
別のPCでJ-OCTAを稼働させて計算条件やデータセットを作り、同じネットワーク内のこのPC上で、LAMMPSでの並列計算を実施する想定です。

頂戴したご要望を踏まえて、弊社からは下記の構成をご提案しました。

CPU	Xeon Silver 4416+ (2.00GHz 20コア) x2
メモリ	128GB REG ECC
ストレージ	1TB SSD M.2
ビデオ	NVIDIA T400 4GB (MiniDisplayPort x3)
ネットワーク	on board (10GBase-T x2)
筐体+電源	タワー型筐体 + 1000W
OS	Red Hat Enterprise Linux Workstation Standard 1Y

ご予算120万円の範囲内で、ある程度のコア数を確保できるCPUを選択した構成です。

本構成では、ご予算との兼ね合いからGPGPUを想定していませんので、ビデオカードは描画のみを想定したエントリークラス製品を採用しています。 Red Hat Enterprise Linuxについては、お客様よりバージョン8におけるJ-OCTAの動作実績をご連絡いただいたため、ご指定に合わせたOSとしています。

本事例の構成は、お客様から頂戴した条件を元に検討した内容です。
掲載内容とは異なる条件でご検討の場合でも、お気軽にご相談ください。

■キーワード

・LAMMPSとは
LAMMPS (Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator) は、米国のサンディア国立研究所で開発されたオープンソースの分子動力学計算アプリケーション。パラメータ設定により対応する力場の幅広さと柔軟さに定評がある。

参考：LAMMPS Molecular Dynamics Simulator ※外部サイトに飛びます

・Red Hat Enterprise Linuxとは
Red Hat Enterprise Linuxは、Red Hat社が開発・提供している企業向けLinuxディストリビューション。長期にわたる安定した運用、セキュリティ、相互運用性、スケーラビリティなどエンタープライズ領域でのニーズに対応したLinuxプラットフォームを提供している。サブスクリプション型のサポートを通じて、継続的なアップデートや技術サポートを受けることが可能。クラウドやコンテナ、仮想化などにも対応し、幅広い用途で利用されている。