お客様より、科学技術計算用マシンのご相談をいただきました。
CPUとストレージのI/O負荷の高い計算での利用を予定されており、以下のような構成がご希望です。
CPU：AMD EPYC 7763 x1
メモリ：RDIMM 32GB x8
GPU：RTX3080
SSD：2TB NVMe M.2 x10 (M.2拡張カード x4利用)
HDD：18TB NAS用 x2台
筐体：4U筐体 (スライドレール込み)
オプション：瞬断とサージ対策用のUPS、LANケーブル10m、メンテナンス用のキーボード・マウス・ディスプレイ
予算：300万円程度
実際のお問い合わせでは、ショートパーツも含めて各パーツに対して詳細に型番をご指定いただきましたが、ご指定パーツ全てに対して相性を確認することが難しいため、弊社製PCとして動作を保証できる構成にてご提案しました。ご連絡いただいた条件の本質的な部分を押さえつつ、ご案内可能な構成に落とし込んだ内容です。
【筐体】
4Uラックマウント筐体よりもパーツ選択の自由度が高いタワー型としており、冷却には弊社が同様の構成で標準採用している水冷クーラーを搭載しています。
【ストレージ】
ストレージI/O負荷の高い科学技術計算を目的としていることから，最も重要なポイントはストレージ構成と考えました。
しかし、ご要望の「M.2 SSD x10本とM.2拡張カード x4枚の組み合わせ」はPCI-Expressスロットを大量に消費することや、ストレージ容量の分散という観点から、必ずしも利用効率が良いとは言い難いため、本質的なご要望を推測した構成を検討しました。
お問い合わせの中でお客様からご指定いただいたM.2拡張カードはSSDを2本搭載できる製品でしたが、これを4枚利用しても搭載できるM.2 SSDは8本までです。残り2本のSSDはマザーボードに直接搭載する想定と判断し、それに近い構成になるよう、マザーボードに4TB SSD M.2 x1本 ＋ 15.3TB SSD U.3 x1本 を直接搭載する形にしています。どちらのSSDもNVMe対応ですので、性能面ではお客様の想定仕様との差はありません。
こちらの構成であれば、15.3TBの領域を1ボリュームとして扱うことができ、SSDを複数搭載する場合と比べてデータ保存領域の効率が改善します。
【CPU】
ご希望のEPYC 7763は入手に時間を要するため (2022年9月現在) 、同じ64コア製品のThreadripper pro 5995WXとしています。
【ストレージ速度とRAID0について】
お客様よりストレージ速度の向上を目的として、当初希望していた2TB NVMe x8本を搭載することにより、アクセス性能はストレージ本数分だけ乗算されるのではないかというご質問をいただきましたが、単純にSSDを8本搭載する場合、1本文のアクセス性能をおったSSDが独立して8本搭載された状態となるため、SSDの数だけアクセス性能が向上するということはありません。
アクセス性能を向上させるプランとしては、複数のSSDでRAID0を構築し1本分以上のアクセス性能を実現する方法が考えられます。
ただし、RAIDにはオーバーヘッド (処理・伝送するために余計にかかる負荷や時間) があり、ストレージ2台でRAID0を構築しても、アクセス性能は2倍を下回ります。また、オーバーヘッドはストレージの数が増えるほど大きくなる傾向があります。
以前に弊社にてSSD x4本でハードウェアRAIDを利用しRAID0を構築した際には、およそ2.5倍程度の速度向上にとどまりました。ソフトウェアRAIDで構築する場合には、RAIDボリュームの制御をOS上でソフトウェア的に行うため、ハードウェアRAIDよりもオーバーヘッドが更に大きくなるとお考えください。
また、RAID0の導入における無視できない要素として、対障害性への懸念があります。
RAID0はボリュームを構築するストレージの1台が故障すると、データが全損します。仮に8本のSSDでRAID0を構築した場合、同じ容量の1本のSSDに対して、一定幾何の障害発生率は理論上約8倍になります。
RAID0はハードウェア障害に対して基本的に脆弱であるという前提のもと、データバックアップ等をご検討いただくのが良いかと存じます。
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逆説的に、1本のSSDで完結させるメリットは、構成がシンプルになり相対的に障害に対して強くなる点にあるとお考えください。
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【主な仕様】
| CPU | Ryzen ThreadripperPRO 5995WX (2.70GHz 64コア) |
| メモリ | 256GB |
| ストレージ1 | 4TB SSD M.2 |
| ストレージ2 | 15.3TB SSD U.3 |
| ストレージ3 | 18TB HDD S-ATA (NAS用) |
| ビデオ | NVIDIA Geforce RTX3080 |
| ネットワーク | on board (1GbE x1 10GBase-T x1) |
| 筐体+電源 | タワー筐体 + 1200W |
| OS | Fedora 36 Workstation |
| UPS | OMRON BN150T ラインインタラクティブ 1500VA/1350W |
| その他 | 21.5型液晶ディスプレイ，LANケーブル 10m |
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