TEGAKARI
  • ホーム
  • 海外製品 新着情報 (ユニポス)
  • 研究開発用PC 構成事例 (テグシス)
  • 研究開発者向けサービス情報
    • レンタルサービス tegakari
  • 技術情報記事
  • バージョンアップ情報
  • テガラからのお知らせ
  • お問い合わせ
ピックアップ新着記事
  • [ 2025年7月4日 ] 第2回:親切な個別対応で、研究費をムダなく活用! 海外製品も国内機器も安心導入ガイド 海外製品 新着情報 (ユニポス)
  • [ 2025年7月2日 ] 第1回:若手研究費、どう使う? 研究の武器になる“ツール選び”の第一歩 海外製品 新着情報 (ユニポス)
  • [ 2025年7月2日 ] WSL2・Dockerセットアップ済みマシン 研究用ワークステーション
  • [ 2025年6月27日 ] 【2025年版】若手研究者応援キャンペーンを紐解く 海外製品 新着情報 (ユニポス)
  • [ 2025年6月25日 ] WIEN2k用マシン おすすめモデル (2025年6月版) 研究用ワークステーション

ホーム > 研究開発用PC 構成事例 (テグシス) > 研究用ワークステーション > ナノポアシーケンサー解析用マシン (2CPU仕様)

ナノポアシーケンサー解析用マシン (2CPU仕様)

2023年1月31日 テガラ株式会社 研究用ワークステーション, 研究開発用PC 構成事例 (テグシス)

お客様より、ナノポアシーケンサーによる長鎖のDNA解析を行うためのマシンをご相談いただきました。
想定されている条件は以下の通りです。

・CPU:2CPU構成が望ましい
・メモリ:64GB程度
・ストレージ:2TB以上のSSD データ保存領域にはNASを利用する
・GPU:NVIDIA RTX2060以上 予算内で最も性能の高いGPUを希望
・OS:Ubuntuインストール予定 (OSなしでの出荷を希望)
・予算:90万円程度

ご連絡いただいた内容を踏まえて、弊社からは以下の構成をご提案しました。

【主な仕様】

CPU Xeon Silver 4310 (2.10GHz 12コア) x2
メモリ 64GB REG ECC
ストレージ 2TB SSD M.2
ビデオ NVIDIA RTX A4000
ネットワーク on board (1000Base-T x2)
筐体+電源 タワー型筐体 + 1200W
OS なし

構成検討においては、CPUとGPUに関する条件がポイントとなります。
ご予算を加味して検討すると、両方の条件を同時に満たすことが難しいため、本事例では2CPU構成を優先したご提案としています。
GPUの性能を重視した構成は、事例No.PC-10347Bをご覧ください。

2CPU構成のメリットは、1CPU構成と比較してコア数が多く並列処理性能が高い点と、メモリを最大で2TBまで搭載できる点です。

GPUのRTX A4000は、RTX2060と同程度のクラスですが、ビデオメモリ容量やCUDAコア数など全体的に優位性の高い製品です。

本事例の構成は、お客様から頂戴した条件を元に検討した内容です。
掲載内容とは異なる条件でご検討の場合でも、お気軽にご相談ください。

 

■FAQ

・Nanopore (ナノポア) とは
ナノポアはnm (ナノメートル) サイズの細孔。ナノポアシーケンサーでは、ナノポアを持つ人工膜タンパク質を用い、DNAがナノポアを通る際の電流変化から塩基配列を決定する。ナノポアシーケンサーは、従来の次世代シーケンサーよりもロングリードのDNA解析が可能である点が特長。

 

・MinKNOWとは
ナノポアシーケンサー「MinION」でシーケンスを行うための専用ソフト。
MinION自体はUSBで直接PCにつなげるタイプのシーケンサーで、ある程度のマシンスペックが要求される。

参考:Laboratory and IT Requirements (Oxford Nanopore Technologies) ※外部サイトへ飛びます

・Guppyとは
Guppyは遺伝子配列データをグラフィカルに表示する遺伝子情報表示プログラム。配列中のタンパク質に翻訳される領域や、マーカとして知られている部位に対する注釈などをわかりやすく表示、または編集することができる。

参考:GUPPY 遺伝子情報表示プログラム (産業技術総合研究所) ※外部サイトへ飛びます

 

 

■ このPC事例に関する詳細、お問い合わせはこちら
ナノポアシーケンサー解析用マシン (2CPU仕様)

※事例の名称またはご希望の条件などをご記入ください。

  • バイオインフォマティクス
  • ナノポアシーケンサー
  • DNA

この記事を読んだ方はこんな記事も読んでいます

研究開発用PC 構成事例 (テグシス)

トランスクリプトーム解析用マシン

2023年2月9日 テガラ株式会社 研究用ワークステーション, 研究開発用PC 構成事例 (テグシス)

発生生物学の研究に携わるお客様より、イネのトランスクリプトームおよびゲノムデータにおける一連のデータ解析 (前処理、マッピング、DEGsの算出等) を不満なく行 […続きを見る]

研究開発用PC 構成事例 (テグシス)

NGS解析用ワークステーション (予算100万円)

2023年3月29日 テガラ株式会社 研究用ワークステーション, 医学・看護学・薬学, 生物学・農学, 研究開発用PC 構成事例 (テグシス)

NGS解析用のワークステーションを導入したい。 業務上の事情で解析内容の説明はできないが、下記の条件で見積もって欲しい。 ・OS:Ubuntu (インストールな […続きを見る]

医学・看護学・薬学

NGS解析&ナノポアシーケンサー解析用マシン

2023年3月23日 テガラ株式会社 研究用ワークステーション, 医学・看護学・薬学, 生物学・農学, 研究開発用PC 構成事例 (テグシス)

簡易的なNGS解析とナノポアシーケンサー解析を予定されているお客様より、専用マシンの導入をご相談いただきました。 具体的にはMaSuRCAを利用した30Mb程度 […続きを見る]

サイト内検索:

テガラ株式会社 YouTube動画

【IR Pass Filter の効果】RealSense D435 と D435f でホワイトボードを撮影

最新の投稿動画を表示しています。
この他の動画はテガラ株式会社 Youtubeチャンネルをご覧ください

人気の記事 (過去7日間のアクセスランキング)

  • 【製品紹介】Leap Motion Controller 2 – 手や指の動きを認識するハンドトラッキングカメラ 2023年6月9日
  • プロジェクションマッピングソフトウェア「MadMapper」の 最新バージョン 5 が正式リリースされました 2021年12月23日
  • furix BetterWMF and CompareDWG tools for AutoCAD 【製品紹介】Beyond Compare:ファイル、フォルダの比較・統合・同期ユーティリティ 2022年11月18日
  • 【製品紹介】MarineTraffic : 船舶に関するリアルタイム情報提供サービス(サブスクリプションプラン) 2023年4月6日
  • 【リリース情報】リモートアクセス RealVNC VNC Connect | ライセンス形態変更のお知らせ 2023年6月29日

最新投稿記事

  • 若手研究者応援キャンペーン × ユニポス.net
    第2回:親切な個別対応で、研究費をムダなく活用! 海外製品も国内機器も安心導入ガイド
    2025年7月4日
  • 若手研究者応援キャンペーン × テグシス
    第1回:若手研究費、どう使う? 研究の武器になる“ツール選び”の第一歩
    2025年7月2日
  • WSL2・Dockerセットアップ済みマシン
    2025年7月2日
  • 若手研究者応援キャンペーンを紐解く【2025年版】テガラ株式会社
    【2025年版】若手研究者応援キャンペーンを紐解く
    2025年6月27日
  • WIEN2k用マシン おすすめモデル (2025年6月版)
    2025年6月25日

注目のタグ

解析ツール (56) 3Dカメラ (55) 機械学習(マシンラーニング) (53) AI (47) ロボティクス (45) VR (44) ロボットアーム (42) バイオインフォマティクス (42) RealSense (41) 統計解析 (39) 動画・映像 (37) デプスカメラ (36) SBC (36) DeepLearning (36) 小型SBC (35) IoT (35) 計装 (35) シミュレーション (33) スペクトル (33) データ解析 (31) 第一原理 (29) Python (29) サイバーセキュリティ (28) 化学 (27) AR (27) JavaScript (27) 次世代シーケンサー (27) .NET (26) 車載 (25) LIDAR (25) 画像解析・画像検査 (25) Metashape (25) 画像処理 (25) UI (24) MATLAB (24) フォトグラメトリー (23) 分子生物学 (22) プロトタイプ (22) 教育ロボット (22) 3Dモデル (22) サポート (22) Web開発・制作 (21) 計測器 (21) マテリアル (20) テストツール (20) GIS (20) ドローン (19) ROS (19) ロボットハンド (19) セキュリティー (19) モバイルロボット (19) アニメーション (19) 可視化 (19) 心理学 (19) ロボット (19) 遺伝子 (18) 脳波 (18) プログラミング (18) ToF (18) 電磁界解析 (18) 自律走行車 (18) プロトコル (18) CAE (17) Raspberry Pi (17) モーションキャプチャ (17) DNA (17) 3Dプリンタ (17) トラッキング (17) ディープラーニング (17) 臨床 (17) 構造解析 (16) チャート (16) 3Dモデリング (16) バイオアッセイ (16) 産業用 (16) モデリング (16) 教育 (16) 生物統計学 (15) 医薬品開発 (15) RNA (15) 3Dスキャン (15) ライブラリ (15) 分子動力学 (15) Arduino (15) AR/VR (15) 流体解析 (15) 動画編集 (15) 写真 (14) CFD (14) CUDA (14) 2022年7月 配信記事 (14) 情報発信12月号 (14) 装置制御 (14) SLAM (14) 周辺機器 (14) 刺激呈示 (14) 農業・農学 (14) マルウェア (14) 2022年8月 配信記事 (14) 監視 (13) ナノ構造材料 (13) IDE(統合開発環境) (13) 3DCAD (13) 開発・評価キット (13) 制御 (13) STEM/STEAM教育 (13) 24時間稼働 (13) 数値解析 (13) デプスセンサ (13) ゲノム解析 (13) 測量 (13) 無線 (13) 熱流体解析 (13) 音声処理 (13) 遠隔操作(リモートコントロール) (12) キャプチャグローブ (12) GPGPU (12) CAD (12) DeepLabCut (12) 情報発信22年4月号 (12) Looking Glass (12) 自然科学 (12) 情報発信22年3月号 (12) FDTD法 (12)
分野別に情報を探す – Category
  •  人文学・社会科学
  •  数物系科学
  •  化学
  •  工学
  •  医学・看護学・薬学
  •  生物学・農学
  •  情報学
 
  •  人工知能
  •  ロボティクス
  •  センサー技術
  •  開発キット・電子工作
  •  デジタルガジェット
  •  自動車・車両(vehicle)関連
  •  産業用通信技術
  •  アプリケーション開発・プログラミング
  •  ネットワーク・セキュリティ
  •  マルチメディア(映像・画像・音声)処理
  •  業務支援・効率化ツール
Translate
お問い合わせフォーム – Contact
TEGAKARI へのお問い合わせはこちら
サイト内リンク
プライバシーポリシー
運営WEBサイト (サービス)
テガラ株式会社
テガラ株式会社コーポレートサイト

UNIPOS
研究開発者向け海外製品調達・コンサルテーションサービス

テグシス
研究用・産業用PCの製作・販売サービス
SNSアカウント
  • Twitter
  • YouTube
  • Facebook

テガラ株式会社

テガラは、研究開発者さまに有用な製品・サービス・情報を統合的 (integrated) に提供するプラットフォームです。「研究開発を加速するお手伝い」

Copyright © 2020 | テガラ株式会社