お客様より、タンパク質の立体構造を解析するツール「AlphaFold2」を使用するためのマシンのご相談をいただきました。事例No.PC-9327と同程度のマシンをご希望です。
PC-9327の構成は一部パーツが終息しているため、ほぼ同一のアーキテクチャーを採用するXeon W-2200シリーズを採用した仕様をご提案させていただきました。
AlphaFold2は、計算処理においてGPU性能に影響を受ける部分がかなり大きいことや、データベースのサイズが約2.7TBと大きく、計算中も頻繁にアクセスするため、データベースを格納するストレージデバイスの性能が使用感に影響します。
本構成ではデータベース用のストレージを4TBのHDDとしていますが、速度重視の場合には事例No.PC-10260Aをご検討ください。
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【主な仕様】
| CPU | Xeon W-2255 (3.70GHz 10コア) |
| メモリ | 64GB |
| ストレージ1 | 500GB SSD S-ATA |
| ストレージ2 | 4TB HDD S-ATA |
| ビデオ | NVIDIA RTX A4000 |
| ネットワーク | on board (10/100/1000Base-T x1 5G x1) |
| 筐体+電源 | ミドルタワー筐体 + 850W |
| OS | Ubuntu 20.04 |
| その他 | CUDA Toolkit 11インストール |
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