Nanopore MinION Mk1D対応省スペースワークステーション | 研究開発者向け情報発信メディア TEGAKARI

Oxford Nanopore MinION Mk1D の推奨要件を満たす卓上型PCの導入についてご相談をいただきました。
OS は Ubuntu 24.04 LTS、メモリ 32GB、ストレージ 2TB SSD、CPU は Intel i7 (12 コア以上) を条件とし、GPU は NVIDIA RTX 5090 またはラップトップ向け GPU を希望されています。
予算は 47 万円以内で、拡張性よりもコンパクトな設置性を優先されています。

参考：MinION Mk1D IT要件 _ Oxford Nanopore Technologies

CPU	Intel Core Ultra 7 265K 3.90GHz(8C/8T)+3.30GHz(12C/12T)
メモリ	合計32GB DDR5 6400 16GB x 2
ストレージ1	2TB SSD M.2 NVMe Gen4
ビデオ	NVIDIA GeForce RTX5060Ti 16GB
ネットワーク	2.5Gbｘ1，Wi-Fi 7
筐体+電源	ミドルタワー型筐体＋850W Cybenetics Gold
OS	Ubuntu 24.04

GPUの選定と予算調整

推奨要件を満たす構成を検討しました。
RTX 5090を採用する場合は、ご予算の47万円を大幅に上回ります。
そのため、今回のご提案ではOxford Nanopore MinION Mk1Dの最小要件を満たすGeForce RTX 5060Ti (16GB) を選定しています。
CPUはIntel Core Ultra 7 (8+12コア) 、メモリ32GB、ストレージ2TB SSDを搭載。
性能と予算のバランスを実現した構成です。

コンパクト筐体の採用

省スペース性を重視した「Define7 Compact」を採用しています。
サイズは幅210mm×高さ474mm×奥行427mmで、限られたスペースでも快適に運用可能です。

一方で、筐体サイズおよびエアフロー設計の制約から、発熱量が大きい高消費電力のGPUや、カードサイズの大きいGPUの搭載は推奨していません。
高いGPU性能を重視される場合は、十分なエアフローを確保できる、より大型筐体の採用が前提となります。

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キーワード

MinION Mk1Dとは

MinION Mk1Dは、Oxford Nanopore Technologies社が提供するポータブルなDNA/RNAシーケンサー。
リアルタイムで長鎖リードの取得が可能で、ゲノム解析、メタゲノム解析、トランスクリプトーム解析など幅広い分野に対応。USB接続で動作し、フィールドワークやラボでの迅速な遺伝子解析に最適。ナノポア技術により、従来のシーケンサーでは困難だった構造変異やエピジェネティクス解析にも対応可能。