お客様より、LAMMPSでの分子動力学計算と機械学習ポテンシャルを用いた計算のためのワークステーションをご相談いただきました。
ご予算150万円程度での見積もりをご希望で、将来的にGAMESSなどCPU負荷の高いアプリも利用する想定があるため、バランスの良い計算機構成をご要望です。
ご連絡いただいた条件を踏まえて、弊社からは下記の構成をご提案しました。
| CPU | Intel Xeon W5-2565X 3.20GHz (TB3.0時 最大4.8GHz) 18C/36T |
| メモリ | 合計128GB DDR5 5600 REG ECC 32GB x 4 |
| ストレージ | 2TB SSD M.2 NVMe Gen4 |
| ビデオ | NVIDIA RTX PRO5000 48GB (DisplayPort x4) |
| ネットワーク | on board (2.5GbE x1 /10GbE x1) |
| 筐体+電源 | ミドルタワー 1500W 80PLUS PLATINUM |
| OS | Microsoft Windows 11 Professional 64bit |
本構成では、事例No.PC-TW2D265278から一段階性能を引き上げ、GPU計算と機械学習の双方で高いパフォーマンスを発揮できる、バランスの良いワークステーションを目指しました。
LAMMPS、機械学習処理、さらには将来的な計算規模の拡大を見据え、GPUリソースの強化とCPU性能の維持を両立した設計です。
- 参考：事例No.PC-TW2D265278 LAMMPS用ワークステーション：予算150万円構成 (2026年2月版)
- 参考：事例No.PC-TW2D265296 LAMMPS用ワークステーション：予算280万円構成 (2026年2月版)
GPU構成：RTX PRO 5000 (48GB) を採用
本構成の中心となるのは NVIDIA RTX PRO 5000 (48GB) です。
事例No.PC-TW2D265278の PRO 4000 (24GB) に比べてVRAMが倍増したことで、
- 大規模分子系を扱うシミュレーション
- 機械学習モデルでのバッチサイズ拡大
といった用途で、研究の自由度が大きく向上します。
さらに、DisplayPort ×4 の出力構成により、多画面環境にも柔軟に対応します。
CPU構成：Xeon W5-2565X (18コア) を継続採用
GPUを強化しつつ、CPUは従来と同じ Xeon W5‑2565X (18コア／36スレッド) を採用しています。
GPU主体のワークロードであっても、
- LAMMPS の CPU 併用計算
- 前処理・後処理の安定した実行
が重要となるため、コア数・クロック・メモリ帯域のバランスが取れた本CPUを継続することで、全体の処理効率を維持しています。
メモリ・ストレージ構成
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- 128GB DDR5 ECC (32GB ×4)
大規模データ処理や長時間計算を安定して実行できる構成 - 2TB NVMe SSD (Gen4)
解析ファイルの高速読み書きに対応し、日常的な入出力を快適に
- 128GB DDR5 ECC (32GB ×4)
拡張性と安定性
PCIe x16 スロットを4基搭載し、将来的なGPUの増設にも柔軟に対応できます。
電源は 1500W Platinum を選定し、高負荷計算を長時間行う研究環境でも安定運用が可能です。
テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
お客様のニーズに合わせて最適なソリューションをご提供しますので、どうぞお気軽にお問い合わせください。
キーワード・LAMMPSとは LAMMPS は大規模な原子・分子系を扱えるオープンソースの分子動力学シミュレーションソフトです。 ・GAMESS (US) とは GAMESS (US) は、アイオワ州立大学のMark Gordon教授らが開発した第一原理量子化学パッケージ。Hartree-Fock法や密度汎関数法 (DFT) などの計算手法をサポートし、電子相関補正や励起状態計算など高度な機能を備えている。また、フラグメント分子軌道法 (FMO) や溶媒効果を含む計算も可能で、幅広い分子物性解析に対応。 |
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